尼康D40x的卡口仍然是尼康F卡口，7个镜头信号接点，三点对焦方式，由于金属连杆被取消，所以只能使用搭载超声波对焦马达的AF-S或者AI-S镜头才能实现自动对焦。目前市场，搭载超声波对焦马达的镜头正在逐渐增多，副厂的支持也明显加强，尼康正在逐渐将主流镜头过度。

　　这就是首次在D系列低端机型中引入防尘功能。D60 所用的防尘系统和佳能、奥林巴斯的并不一样，是被称之为气流防尘的系统，它是将反光镜盒中的空气导向底座附近的小管中，从而使灰尘远离影像感应器。同时影像感应器除尘功能还可利用专门设计的振动来降低感应器附近的积尘，该功能可自动激活或由拍摄人员随时激活。气流防尘配合低通滤镜的超声波振动除尘形成综合除尘系统，可以有效防止CCD以及暗箱内部的灰尘积聚。这样一来，摄影爱好者再也不用担心，因为频繁更换镜头，而造成CCD表面被污染，画面莫名其妙出现固定黑点的情况。

　　在D60与D40x的差别中，最明显的就是图像处理引擎的变化。尼康D60采用了和D3/D300一样的，在阴影效果高效解除能力和画像处理速度方面得到认可的数码影像处理概念EXPEED，色彩更鲜明，表现力更丰富，而且还添加了420分割3D-RGB测光CCD。